微生态制剂又称微生态调节剂，是根据微生态学原理，利用对宿主有益的正常微生物或其促进物质制备成的制剂，具有维持或调整微生态平衡、防治疾病和增进宿主健康的作用。

益生菌类药物一般饭后30-60分钟服用，食物中和胃酸，更有利于活菌顺利到达肠道发挥作用。死菌制剂（乐托尔）饭前饭后均可服用。

在儿童中，常会用到散剂或颗粒剂，应用水温＜40℃的温开水或凉开水调服，冲好后应及时服用，以免有效成分受到破坏。若服用胶囊，如果存在吞咽困难，可将胶囊内药粉取出，用温水或牛奶冲服（肠溶胶囊除外）。服用片剂，可将片剂嚼碎后直接服用，也可将药片碾碎后用温水或牛奶溶解后服用（肠溶片除外）。如果小朋友们不愿意喝白开水，也可用牛奶替代。

益生菌为活的微生物，应避免与抗菌药物同时服用，以免影响疗效。若需同时应用抗菌药物，应加大益生菌剂量或错开服药时间，最好间隔2～3 h以上。布拉氏酵母菌、酪酸菌和芽孢杆菌制剂对抗菌药物不敏感，可与抗菌药物同时使用。

由于个体出生后其肠道结构和功能的发育和影响发育因素各有不同，肠道菌群紊乱的程度和方式存在个体差异，因此不同病人对同一药物同一剂量的效果可能出现差异。